Desarrollo de un protocolo de metabarcoding para la indentificación de presas de Totoaba macdonaldi a partir del contenido estomacal

Abstract

Totoaba macdonaldi es una especie de pez en peligro de extinción, endémica del golfo de California y una fuente de sustento para las comunidades en la costa. Debido a la sobre explotación, el gobierno mexicano prohibió su pesca en 1975. Sin embargo, aún es ilegalmente pescada y exportada a China debido a que su vejiga natatoria es de gran valor en la medicina tradicional china. A pesar de su estado de protección, poco se sabe sobre la biología de la totoaba. Para poder optimizar su cultivo e incluir la información de su ecología trófica en los esfuerzos de conservación, la dieta de este pez debe de ser bien caracterizada. Por lo tanto, el objetivo de este estudio fue estandarizar un protocolo de metabarcoding para describir la dieta usando secuenciación de nueva generación. Se disectaron cuatro totoabas silvestres que fueron confiscadas por agentes de las autoridades mexicanas y se colectó el contenido estomacal. Del ADN extraído de las muestras, se generaron librerías de los amplicones representativos para cefalópodos, cordados, invertebrados marinos y eucariotas.