Caracterización genética de variantes del virus de la mionecrosis infecciosa (imnv) y del penaeus vannamei solinvivirus (pvsv) en el Noroeste de México

Abstract

En los últimos años, se han identificado dos virus de ARN vinculados con mortalidades masivas en América Latina: el Virus de la Mionecrosis Infecciosa y el Penaeus vannamei Solinvivirus. En 2023, se observaron muertes inusuales en el noroeste mexicano, posiblemente relacionadas con estos virus. Muestras de P. vannamei de Sonora y Baja California Sur analizadas mediante PCR, RT-PCR, Secuenciación Sanger y Secuenciación Masiva de Próxima Generación revelaron la presencia de Penaeus vannamei Solinvivirus, Virus de la Mionecrosis Infecciosa, Decapod penstyldensovirus 1, y Vibrio parahaemolyticus, causante de AHPND. Mediante análisis de RNAseq se secuencio el genoma completo de la variante mexicana del PvSV nombrándolo PvSV Mex. El genoma de PvSV Mex es de 10,4 kb y codifica una gran poliproteína de 3327 aa, con dominios conservados de helicasa, RdRP, proteína de cubierta de Calicivirus, parche-G, proteína de tegumento y señal de localización nuclear. La secuencia nucleotídica del PvSV Mex muestra un 99.88% de similitud con PvSV. Las técnicas de secuenciación son herramientas esenciales para identificar y comprender estos procesos, contribuyendo al conocimiento del transcriptoma del camarón.