Identificación de sistemas de dos componentes que participan en la regulación de los mecanismos de degradación de hidrocarburos en Rhodococcus ruber MSA 14
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Universidad Autónoma de Baja California.
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La secuenciación masiva de ARN (RNA-seq) se ha consolidado como una herramienta fundamental para el análisis de la regulación transcripcional mediada por sistemas de transducción de señales como los sistemas de dos componentes (SDC), en la adaptación bacteriana a condiciones ambientales y metabólicas variables. Rhodococcus ruber MSA14 es una cepa hidrocarbonoclasta aislada de sedimentos marinos del Puerto de Rosarito, en la Costa de Baja California, México, que utiliza el pireno como única fuente de carbono y energía. Con la finalidad de comprender el proceso molecular de degradación del pireno, en este trabajo se estudió el transcriptoma de MSA14 en respuesta a este hidrocarburo mediante la secuenciación de ARN de alto rendimiento en la plataforma Illumina NovaSeq 6000.
Palabras clave
Oceanografía||Tesis y disertaciones académicas||Biotecnología microbiana Biodegradación
